Le Plan de Gestion des Données de la plateforme est maintenant disponible sur Opidor.

Plan de Gestion des Données PAPPSO.

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.4.50 :

• Changement de nom du logiciel X!TandemPipeline vers i2MassChroQ
• Nouveau manuel d’utilisation disponible en HTML ou PDF
• Intégration du module statistique MCQR
• Distribution dans le paquet i2MassChroQ du logiciel mzxmlconverter
• Distribution dans le paquet i2MassChroQ du logiciel tandemwrapper

mzxmlconverter : conversion des données TimsTOF pro vers mzXML

Cet outil en ligne de commande permet de transformer les données brutes MS2 issues du TimsTOF dans le format standard mzXML. Voir la documentation associée

Le conseil scientifique des utilisateurs de PAPPSO aura lieu le 16 mai 2022 et sera ouvert à tous, utilisateurs de la plate-forme ou intéressés par ses activités. Cette demi-journée d’informations et de présentations sera accessible en présentiel à l’IDEEV (12 route 128, 91190 Gif-sur-Yvette, salle Rosalind Franklin au rez-de-chaussée) ou en visio via le lien suivant (https://orsay.bbb.cnrs.fr/b/lan-l7m-axe-ais)

Le site du Moulon de PAPPSO vient de s’installer dans ses nouveaux locaux situés à l’intérieur du bâtiment flambant neuf de l’IDEEV. Venez nous rendre visite!

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.4.42 :

• Nouveau manuel d’utilisation
• Amélioration de l’affichage des spectres annotés
• Meilleure intégration de R : analyses basiques de XIC, quantité de proétines intégrée
• Amélioration du parser TimsTOF pro TDF
• Amélioration de la qualité de mesure des XICs sur le signal du TimsTOF pro (traitement du bruit de fond)
• tandemwrapper.exe est inclus dans l’archive (utilitaire pour lancer X!Tandem directement sur les répertoires .d de Bruker)
• Correction de bugs d’interface (merci à Kevin ROGER kevin.roger@inserm.fr)
• Formule chimique de chaque peptides identifiés ajoutée aux sorties ODS

Vous pouvez participer au développement, proposer de nouvelles fonctionnalités ou signaler un bug depuis : ForgeMIA gitlab