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Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.4.27 :

• Meilleure prise en charge des données du timsTOF pro : amélioration des performances, visualisation et export de nouvelles données (fenêtre de mobilité 1/K0, énergie de collision)
• Intégration de MassChroQ 2.4.3, prise en charge du timsTOF pro pour la quantification des peptides.
• Identification de peptides avec X!Tandem directement sur les données du timsTOF.

PAPPSO est de nouveau élu au bureau de “Metaproteomics Initiative” (https://metaproteomics.org/ & https://twitter.com/MetaP_Init)

PAPPSO a participé au 4ème symposium de Métaproteomique (luxembourg, 27-29 septembre 2021) et a présenté ses résultats de biomarqueurs potentiels de maladies inflamatoires chroniques des intestins (MICIs).

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.4.3 :

• Prise en charge native du format de données TDF du TimsTofPRO : identification avec X!Tandem, visualisation de spectres MS2, extraction de XICs
• Adaptation aux données de mobilité ionique
• Paramétrage complet de la quantification avec MassChroQ
• Amélioration de la lecture du format mzIdentML
• Amélioration des interfaces graphiques

Merci beaucoup à toutes l’équipe PAPPSO pour ces améliorations et notamment à Thomas Renne, apprenti en bioinformatique, qui a développé la plupart des ces nouvelles fonctionnalités.

PAPPSO adhère à l’initiative COVID-19 Mass Spectrometry Coalition initiée par la British Mass Spectrometry Society et dont l’objectif est d’utiliser la spectrométrie de masse pour lutter contre le virus SARS-Cov2. Les échantillons, expertises, données et protocoles seront partagés entre les chercheurs et ingénieurs massistes pour optimiser et accélérer le développement de méthodes de diagnostic ou de caractérisation et de suivi du virus.