liste de diffusion pappso-tools
Réseaux nationaux en protéomique
- Réseau des Plateformes Protéomiques d’Ile de France
- Réseau MassProt’ INRA : huit plateaux de spectrométrie de masse en France
- Réseau Université Sud Paris Proteome
- Réseau du Protéome Vert
Sociétés et organisations
- Société Française d’Electrophrèse et Analyse Protéomique
- Société Française de Spectrométrie de Masse
- European Protomics Association
- American Society for Mass Spectrometry
- Association of Biomolecular Resource Facilities
- The Electrophoresis Society
- The Proteome Society
- ASBMB
- Proteome Sciences
- Proteomic world
- Mass Spectrometry and Biotechnology Resource
- Mass Spectrometry Web Address
- ProteinScience.com
- NCBI
- European Bioinformatics Institute
- Swiss Institute of Bioinformatics
Plateformes de protéomique INRA
- Service de spectrométrie de masse pour la protéomique de Tours
- Plate-forme de spectrométrie de masse de Nantes
- Plate-forme de protéomique de Montpellier (PPM)
- Plateau de protéomique de Theix
- Plate-forme de spectrométrie de masse de Rennes
- Plateau de biochimie analytique de Sophia Antipolis (ISA, SPIBOC)
Autres plateformes
- IPBS Toulouse
- IFR : IBSM Marseille
- plateforme protéomique de Lille
- LSMBO, Strasbourg
- SICaPS (IMAGIF)
- EDyP, CEA Grenoble
Modifications post-traductionnelles
- Deltamass
- PhosphoDB
- Phosphoelm
- BiowebPasteur
- Findmod
- Glycomod
- Scansite
- NetPhos Server
- PlantsP
- Resid database
- The Protein Domain database
Identification de protéines
- Mascot
- Protein Prospector
- Peptident
- Aldente
- prowl (Profound, X!tandem,peptide map)
- MassSearch
- X-tandem
- Phenyx
- Lutefisk
- pepMAPPER
- Sherpa (MAc uniquement)
- De novo tutorial
Spectrométrie de masse
- sci.techniques.mass-spec http://www.chemistry.gatech.edu/stms
Forum de discussions autour de domaines divers touchant à la spectrométrie de masse
- Now (anciennement Base Peak) : http://www.spectroscopynow.com
- History of Mass Spectrometry : http://masspec.scripps.edu/hist.html
- Tutorial ESI : ionsource
Logiciels de calcul de masse
- Peptide Properties Calculator
- Outil de calcul de masse du NIST
- Gpmaw
- paws
- logiciel de calcul de massif isotopique : ISOTOPIDENT
- The Tools Menu
Serveurs biologiques
- ExPASy Molecular Biology Server
- The National Center for Biotechnology Information : NCBI
- Protein Data Bank PDB
- The Association of Biomolecular Resource Facilities : ABRF
- EMBL
- Matrix science