• Identification de protéines

    • séparées par SDS-PAGE
    • à partir de fractions de peptides séparées par chromatographie liquide (LC)
    • sur mélange de protéines non préalablement séparées (protéomique shotgun), avec un gradient de LC adapté à la complexité de l’échantillon

  • Identification de modifications post-traductionnelles (phosphorylations, glycosylations, acétylations N-terminales,…)

  • Analyse de peptidomes

  • Quantification relative ou semi-absolue de protéines avec ou sans marquage isotopique, par spectral counting ou intégration du signal (XIC).

  • Analyses DIA (sur micro-organismes)

  • Bioinformatique et statistiques

    • Analyses bioinformatiques et statistiques des données d’identification et de quantification
    • Formation aux outils bioinformatiques et statistiques
    • Distribution aux utilisateurs des outils open-source utilisés pour l’identification, la quantification et les analyses statistiques, pour une utilisation sur leurs propres ordinateurs
    • Chargement des données de spectrométrie de masse sur les dépôts publics spécialisés (PRIDE, PROTICdb)