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Journées PROTÉOME VERT des 12 et 13 juin 2023 IDEEV, Université Paris-Saclay, 12 route 128, 91190 Gif-sur-Yvette Salle Rachel Carson

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.4.68 : TimsTOF : nouvel algorithme de correction des dérives en mobilité (considérable amélioration du “match between run”) TimsTOF : nouvel algorithme de résolution de polynômes pour le calcul des masses (plus rapide et plus précis) Quelques corrections de bugs dans l’interface graphique Merci à tous les contributeurs, spécialement à “Sergey Bochkanov” sergey.

Offre de poste d’ingénieur(e) d’études “Développements méthodologiques pour la protéomique végétale à haut-débit” Localisation: Plateforme d’Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO), Université Paris- Saclay, IDEEV, Gif-sur-Yvette (91) Dates: contrat de 12 mois à partir de mars 2023 Salaire brut: 2100-2500 € par mois selon le niveau d’expérience Mots clefs : protéomique, chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS/MS), bioinformatique, logiciel libre, C/C++, machine learning Contexte PAPPSO est une plateforme de protéomique visant à fournir aux équipes de recherche des prestations analytiques à haute valeur ajoutée grâce à ses équipements de pointe et ses compétences en bioinformatique des données de spectrométrie de masse.

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.4.61 : Intégration de TIDD: tool-independent and data-dependent machine learning for peptide identification Nouvelle sortie ODS avec la liste de tous les PSM valides (target et decoy) Amélioration de l’interface des paramètres de sélection (Evalue, FDR ou SVM probability) Ecriture des paramètres de sélection dans les commentaires du MassChroqML Vous pouvez participer au développement, proposer de nouvelles fonctionnalités ou signaler un bug depuis : ForgeMIA gitlab

Offre de poste d’ingénieur(e) d’études “Développements méthodologiques pour la protéomique végétale à haut-débit” Localisation: Plateforme d’Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO), Gif-sur-Yvette (91) Dates: contrat de 12 mois à partir de février 2023 Salaire brut: 2100-2500 € par mois selon le niveau d’expérience Mots clefs : protémique végétale, chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS/MS), développement méthodologique, data independent analysis, microdébit Contexte : PAPPSO (www.