Important modifications since 1.0.3 :

• Export file format for ProteoBench
• Windows setup now including X!Tandem executables
• Better GUI for statistical analysis using MCQR 0.6.14

Complete changelog

Journées PROTÉOME VERT des 10 et 11 juin 2023

Institut Agro, Montpellier

Les journées Protéome Vert sont ouvertes aux personnes intéressées par la protéomique des plantes. Vous êtes invités à y présenter aussi bien les nouveaux développements méthodologiques dans les domaines de la préparation des échantillons, de la spectrométrie de masse et de l’analyse bioinformatique que les résultats biologiques obtenus grâce à la protéomique. Les journées sont organisées par le réseau Protéome Vert.

Important modifications since 0.6.2 :

• Full MCQR (proteomics R package) integration for XIC and spectral count analysis on label free experiments
• Updated user manual
• Using PSI ProForma peptide sequence in peptide details view
• Full_C13N15 labeling method added

Complete changelog

Le conseil scientifique des utilisateurs (CSU) de PAPPSO aura lieu le matin du 26 septembre 2023 et sera ouvert à tous, utilisateurs de la plate-forme ou intéressés par ses activités. Cette demi-journée d’informations et de présentations sera accessible en visio via le lien suivant (https://orsay.bbb.cnrs.fr/b/lan-l7m-axe-ais)

This poster was presented at ProteoAIX 2023.

Using i2MassChroQ to merge identification results from X!Tandem and SpecOMS yields 20% more quantified proteins than MSfragger.