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Plateforme d'Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest

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News

    • 6 janvier 2019
    • bioinfo

    X!TandemPipeline C++ version 0.2.28

    Since last announced 0.2.22 version, many features has been added :

    • bug fix on the protein Evalue computation (the protein Evalue was too severe)
    • automatic check for new version available online
    • new feature to choose tabulated text or ODS for spreadsheet formats
    • better windows integration (icons)
    • more tests and controls to help user to configure the external program X!Tandem
    • better Mascot dat parser
    • graphical bug fix on the size of text (to avoid shrinking)

    X!TandemPipeline homepage

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    • 6 janvier 2019
    • bioinfo

    Atelier PAPPSO - "Les outils bioinformatiques d'analyse des données de protéomique développés par la plateforme PAPPSO"

    La plateforme PAPPSO organise du 19 au 22 novembre 2018 un atelier sur les outils bioinfo qu’elle a développés pour la protéomique.

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    • 6 janvier 2019
    • bioinfo

    MassChroQ version 2.2.12 Black Caiman, Albi edition

    This is a major release of MassChroQ. This will be presented at the joint congress of the SFEAP and SEProt in Albi from 9 to 12 october 2018. This version allows efficient work on huge datasets : 250 samples of high complexity (gut microbiota) and high resolution (Lumos) can be aligned and quantified in 2 days (more than 1 million of XICs for each sample).

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    • 6 janvier 2019
    • bioinfo

    X!TandemPipeline C++ version 0.2.22, Albi edition

    This new version of X!TandemPipeline contains several fixes such as column titles and descriptions in the user interface. This version that will be presented at the joint congress of the SFEAP and SEProt in Albi from 9 to 12 october 2018

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    • 6 janvier 2019
    • bioinfo

    X!TandemPipeline C++ version 0.2.18

    X!TandemPipeline supports now more identification engines. It suports now :

    • X!Tandem
    • mascot
    • OMSSA
    • SEQUEST
    • Comet
    • Morpheus
    • MSGFplus

    Identification engines specific scores, such as Mascot scores, peptide prophet probalities, MS-GF raw score, OMSSA E-value, Comet XCorr… are displayed (if needed).

    Lire la suite…
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News 
Journées du Protéome et Peptidome Verts les 1er et 2 juin 2026 à l'Université de Grenoble Alpes PAPPSO renforce son engagement pour l’agroécologie avec l’acquisition d’un Orbitrap Astral sur son site de Gif-sur-Yvette. PAPPSO rejoint l’infrastructure nationale en protéomique ProFI.
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