Le spectromètre de masse TimsTOF Pro (Bruker) est doté d’un module de mobilité ionique (Tims) qui permet d’accéder à une 4ème dimension : la mobilité ionique (les trois dimensions classiquement obtenues étant le temps de rétention (RT), la masse des ions (m/z) et l’intensité des ions). Cette mobilité ionique permet par exemple, de différencier des peptides isobares portant des modifications post-traductionnelles. La très grande vitesse d’acquisition et la sensibilité de ce spectromètre de masse vont permettre de réduire les temps d’injection et les quantités d’échantillons analysées (à partir de 10 ng d’échantillon), tout en maintenant un très haut niveau d’identification et de quantification des protéines dans des échantillons complexes. L’achat de ce spectromètre de masse s’est accompagné d’un investissement dans un logiciel de traitement des données de mobilité ionique : PEAKS (Bioinformatics Solutions Inc.). PAPPSO implémente également cette mobilité ionique dans ses outils.
Supplier | BRUKER |
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Fragmentation | CID |
Modes acquisition | DDA et DIA PASEF |
Configuration utilisée au laboratoire | Le TimsTOF Pro est couplé à une chaîne nanoElute (BRUKER) |