- t -

• tandemProgressMessage() : pappso::TandemWrapperRun
• TandemWrapperRun() : pappso::TandemWrapperRun
• tic() : pappso::MassSpectrum
• TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget() : pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget
• TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget() : pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget
• TicXicChromTracePlotWidget() : pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• TimsBinDec() : pappso::TimsBinDec
• TimsData() : pappso::TimsData
• TimsDataFastMap() : pappso::TimsDataFastMap
• TimsDdaPrecursors() : pappso::TimsDdaPrecursors
• TimsDiaSlices() : pappso::TimsDiaSlices
• TimsDirectXicExtractor() : pappso::TimsDirectXicExtractor
• TimsFrame() : pappso::TimsFrame
• TimsFrameBase() : pappso::TimsFrameBase
• TimsFrameMobilityTraces() : pappso::TimsFrameMobilityTraces
• TimsFrameRawDataChunck() : pappso::TimsFrameRawDataChunck
• TimsFramesMsRunReader() : pappso::TimsFramesMsRunReader
• TimsFrameType1() : pappso::TimsFrameType1
• TimsMs2CentroidFilter() : pappso::TimsMs2CentroidFilter
• TimsMsFileReader() : pappso::TimsMsFileReader
• TimsMsRunReader() : pappso::TimsMsRunReader
• TimsMsRunReaderBase() : pappso::TimsMsRunReaderBase
• TimsMsRunReaderDia() : pappso::TimsMsRunReaderDia
• TimsMsRunReaderMs2() : pappso::TimsMsRunReaderMs2
• TimsMsRunReaderMs2Selected() : pappso::TimsMsRunReaderMs2Selected
• TimsXicExtractorInterface() : pappso::TimsXicExtractorInterface
• toAbsoluteString() : pappso::Aa, pappso::Peptide
• toJsonObject() : pappso::ProjectParam, pappso::ProjectParameters
• toMap() : pappso::Trace
• toProForma() : pappso::Aa, pappso::AaModification, pappso::Peptide, pappso::specglob::PeptideModel
• toQPaintDevice() : GraphicDeviceWidget, pappso::MassSpectrumWidget, pappso::XicWidget
• toShort4PointsString() : pappso::SelectionPolygon
• toString() : pappso::Aa, pappso::BasePlotContext, pappso::ChemicalFormula, pappso::ColorMapPlotConfig, pappso::DaltonPrecision, pappso::DataPoint, pappso::DeepProtEnumStr, pappso::FilterCeilingAmplitudePercentage, pappso::FilterChargeDeconvolution, pappso::FilterComplementIonEnhancer, pappso::FilterFloorAmplitudePercentage, pappso::FilterLowIntensitySignalRemoval, pappso::FilterMorphoAntiSpike, pappso::FilterMorphoBackground, pappso::FilterMorphoMean, pappso::FilterMorphoWindowBase, pappso::FilterMzExclusion, pappso::FilterNameInterface, pappso::FilterNormalizeIntensities, pappso::FilterQuantileBasedRemoveY, pappso::FilterRemoveY, pappso::FilterSavitzkyGolay, pappso::FilterSuiteString, pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::IntegrationScopeSpec, pappso::IsotopeCount, pappso::MapTrace, pappso::MassSpecTracePlotContext, pappso::MassSpectrumId, pappso::MsDataFormatEnumStr, pappso::MsRunDataSetTreeNode, pappso::MsRunId, pappso::MsRunReadConfig, pappso::MzIntegrationParams, pappso::MzRange, pappso::PeakIonIsotopeMatch, pappso::PeakIonMatch, pappso::Peptide, pappso::PeptideNaturalIsotopeAverage, pappso::PpmPrecision, pappso::PrecisionBase, pappso::QualifiedMassSpectrum, pappso::ResPrecision, pappso::SavGolParams, pappso::SelectionPolygon, pappso::SelectionPolygonSpec, pappso::specglob::ExperimentalSpectrum, pappso::specglob::PeptideModel, pappso::spectree::SpecTree, pappso::Trace, pappso::Utils, pappso::XicCoord, pappso::XicCoordTims
• toSvgFile() : GraphicDeviceWidget
• totalIonCurrent() : pappso::MassSpectrum
• toTrace() : pappso::BaseTracePlotWidget, pappso::MapTrace
• toUtf8StandardString() : pappso::Utils
• toXmlDouble() : pappso::MzIdentMlWriter
• toXmlMass() : pappso::MzIdentMlWriter
• toXmlMassDelta() : pappso::MzIdentMlWriter
• Trace() : pappso::Trace
• TraceCombiner() : pappso::TraceCombiner
• TraceDetectionMoulon() : pappso::TraceDetectionMoulon
• TraceDetectionZivy() : pappso::TraceDetectionZivy
• TraceMinusCombiner() : pappso::TraceMinusCombiner
• TracePeak() : pappso::TracePeak
• TracePeakList() : pappso::TracePeakList
• TracePlusCombiner() : pappso::TracePlusCombiner
• transformToMonoChargedForAllDataPoint() : pappso::FilterChargeDeconvolution
• translateAaModificationFromUnimod() : pappso::Utils
• translateAligned2OriginalRetentionTime() : pappso::MsRunRetentionTime< T >
• translateOriginal2AlignedRetentionTime() : pappso::MsRunRetentionTime< T >
• Translater() : pappso::MzxmlOutput::Translater
• translateXicCoordFromTo() : pappso::IonMobilityGrid
• transpose() : pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::SelectionPolygon
• transposeAxes() : pappso::BaseColorMapPlotWidget
• tryBetterPositionOffsets() : pappso::specglob::PostTreatment
• tryToCumulateOffSets() : pappso::specglob::PostTreatment
• tryToRemoveOffsets() : pappso::specglob::PostTreatment
• twofft() : pappso::FilterSavitzkyGolay